211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2899 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  96.45 
 
 		 338 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  100 
 
 		 338 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  91.74 
 
 		 340 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  77.98 
 
 		 378 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  77.98 
 
 		 378 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  77.98 
 
 		 335 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  74.47 
 
 		 339 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  75.23 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  75.23 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  75.23 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  75.23 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  74.92 
 
 		 339 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  78.59 
 
 		 334 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  74.61 
 
 		 331 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  77.98 
 
 		 335 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  77.98 
 
 		 334 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  79.2 
 
 		 335 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  74.92 
 
 		 307 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  58.64 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  61.11 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  60.19 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  59.88 
 
 		 326 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  60.06 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  56.04 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  54.85 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  53.85 
 
 		 373 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  53.23 
 
 		 331 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  51.09 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  55.52 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  53.82 
 
 		 350 aa  315  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  50.46 
 
 		 339 aa  298  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  49.54 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  49.09 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  49.11 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  47.68 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  48.64 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  50.75 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  50.75 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  26.58 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  28.47 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  28.47 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  27.5 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  26.1 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  26.55 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  29.33 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  26.5 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.45 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  28.29 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  29.3 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  28.52 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  26.17 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  27.53 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  28.86 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  29.79 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  27.46 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  25.98 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  25 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  27.3 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  25 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  27.1 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  22.22 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  22.92 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  26.41 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  25.4 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  27.53 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  28.03 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.04 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.04 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.04 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  25.85 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  25 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  23.47 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  23.31 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  26.15 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  25.25 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  27.55 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  24.42 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  26.12 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  26.61 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  25.59 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  24.83 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  24.83 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  31.65 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  31.65 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.65 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  27.56 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  26.12 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  31.65 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.65 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  31.65 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  26.12 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  29.44 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  26.88 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  25.4 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  29.61 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  26.51 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.19 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  27.2 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>