269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1538 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
367 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  78.47 
 
 
367 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  57.1 
 
 
371 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  57.1 
 
 
371 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.78 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  51.72 
 
 
354 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  51.26 
 
 
355 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  52.17 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  52.17 
 
 
354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.76 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  48.99 
 
 
367 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  51.26 
 
 
355 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.74 
 
 
354 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  49.58 
 
 
366 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  42.81 
 
 
353 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.25 
 
 
360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.62 
 
 
382 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.57 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.32 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.96 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.6 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.49 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  27.22 
 
 
354 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.48 
 
 
375 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  30 
 
 
373 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  25.17 
 
 
344 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.17 
 
 
344 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  30.34 
 
 
350 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.93 
 
 
378 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.36 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.58 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
397 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.19 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.52 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.41 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.64 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0815  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.63 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.1 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.75 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.96 
 
 
389 aa  60.1  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.02 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.32 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.26 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.8 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.11 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.51 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04330  Isovaleryl-CoA dehydrogenase 2, mitochondrial precursor, putative  25.87 
 
 
417 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4014  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 
386 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3185  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.77 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.02 
 
 
389 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3247  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7011  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.22 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.29 
 
 
390 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.51 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  26.94 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.35 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.74 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  27.8 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.68 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.14 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.02 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3835  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.41 
 
 
406 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.49 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  22.47 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0824  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.21 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.294014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0727  hypothetical protein  34.68 
 
 
224 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0730349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  25.54 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0818  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.83 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.91 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0313  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.48 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740089  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.57 
 
 
387 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33835  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.74 
 
 
390 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.51 
 
 
389 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1354  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.37 
 
 
385 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.67 
 
 
390 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.51 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.71 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  22.73 
 
 
395 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.51 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.51 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1659  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.87 
 
 
390 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5062  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.19 
 
 
387 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.4 
 
 
385 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  28.28 
 
 
377 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.4 
 
 
385 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  26.42 
 
 
580 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3810  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.44 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.77 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.1 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.28 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.35 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.35 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.35 
 
 
424 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4277  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.75 
 
 
579 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.943677  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3114  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.8 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3005  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.8 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  26.29 
 
 
407 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>