More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1052 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  90.24 
 
 		 420 aa  788    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  100 
 
 		 420 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  62.23 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  62.77 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  61.96 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  33.67 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  30.73 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  29.63 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  27.16 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  29.9 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  31.23 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  29.27 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  26.24 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  26.56 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  26.48 
 
 		 403 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  28.88 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  27.67 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  30.08 
 
 		 379 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  31.12 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  28.84 
 
 		 423 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  28.47 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  29.52 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  27.7 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  27.7 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  27.45 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  30.17 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  26.78 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  27.45 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  27.7 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  27.96 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  27.75 
 
 		 377 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  25 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  25 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  25 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  25 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  25 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  27.51 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  27.58 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  27.68 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  28.19 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  25.27 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  25.27 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  25 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  25 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  25 
 
 		 366 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  25 
 
 		 366 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  25 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  24.87 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  25 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  24.73 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.25 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.12 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  43.94 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.52 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  48.44 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  43.53 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  22.8 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  42.42 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.63 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  32.86 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  29.71 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  43.08 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  39.56 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3650  dihydroorotase  41.54 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  35.29 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.78 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.88 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  35.71 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.29 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  39.68 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  38.89 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  42.53 
 
 		 535 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.88 
 
 		 432 aa  53.5  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  41.43 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  30.67 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.25 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  38.54 
 
 		 474 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  41.54 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  22.87 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  35.42 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.36 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  41.54 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  39.58 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  44.12 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.32 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  42.62 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  30.5 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  40 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  41.43 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  34.44 
 
 		 528 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  29.71 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  25.37 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  35.94 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  31.63 
 
 		 459 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.3 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.19 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>