More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3270 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3270  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 712 aa  1429    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.308158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1694  CheA signal transduction histidine kinases  71.75 
 
 		 715 aa  989    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0385  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.94 
 
 		 733 aa  298  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.222748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 795 aa  111  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 681 aa  110  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 1736 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.11 
 
 		 795 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.11 
 
 		 795 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0958  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 1286 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 793 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  32 
 
 		 928 aa  107  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 803 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 760 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 871 aa  105  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 649 aa  103  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  33.89 
 
 		 742 aa  103  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 695 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3149  CheA signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 1576 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 686 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 713 aa  102  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  32.39 
 
 		 916 aa  102  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  35.2 
 
 		 766 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  31.82 
 
 		 770 aa  102  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  36.96 
 
 		 819 aa  101  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 728 aa  101  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  33.9 
 
 		 662 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 921 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 796 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 916 aa  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 740 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2118  CheA signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 780 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521154  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  31.64 
 
 		 934 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  31.64 
 
 		 922 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 695 aa  100  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 688 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 921 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 664 aa  100  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 989 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 675 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 		 794 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 		 794 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 989 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.81 
 
 		 1971 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 747 aa  99.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 657 aa  99.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  32.54 
 
 		 601 aa  99.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 783 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.1 
 
 		 1956 aa  98.6  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 1078 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 701 aa  98.6  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  40.15 
 
 		 1643 aa  99  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 911 aa  98.6  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  25.8 
 
 		 796 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 536 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 682 aa  98.2  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.68 
 
 		 769 aa  97.8  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.68 
 
 		 769 aa  97.8  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  31.64 
 
 		 870 aa  98.2  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 763 aa  97.8  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 604 aa  97.8  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 812 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 759 aa  97.8  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.11 
 
 		 769 aa  97.8  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 758 aa  97.8  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 742 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 2022 aa  97.4  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 666 aa  97.4  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 607 aa  97.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 735 aa  97.4  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.52 
 
 		 639 aa  97.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 1832 aa  97.4  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 679 aa  97.4  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  30.77 
 
 		 610 aa  97.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  30.72 
 
 		 715 aa  97.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 603 aa  96.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  40.3 
 
 		 747 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  28.65 
 
 		 764 aa  97.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.3 
 
 		 806 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 1065 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.91 
 
 		 927 aa  97.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 652 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 741 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  39.71 
 
 		 758 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1958  sensor histidine kinase  24.75 
 
 		 794 aa  96.3  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.76 
 
 		 1180 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 694 aa  96.3  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.73 
 
 		 942 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 675 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  33.83 
 
 		 1010 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 598 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 792 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 878 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.46 
 
 		 734 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  29.59 
 
 		 1104 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  30.68 
 
 		 783 aa  96.3  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 935 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 781 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 660 aa  95.5  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 770 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>