205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5787 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  100 
 
 		 488 aa  987    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  59.75 
 
 		 485 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  58.33 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  58.57 
 
 		 499 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  57.58 
 
 		 485 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  60.08 
 
 		 484 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  59.96 
 
 		 484 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  59.47 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  57.92 
 
 		 507 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  59.96 
 
 		 484 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  59.96 
 
 		 484 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  57.72 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  57.78 
 
 		 507 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  57.78 
 
 		 507 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  58.57 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  34.03 
 
 		 480 aa  286  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  32.21 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  28.99 
 
 		 790 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 791 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  25.29 
 
 		 546 aa  163  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 824 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 790 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  30.62 
 
 		 582 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  22.93 
 
 		 491 aa  96.7  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  22.49 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  24.06 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  21.41 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  22.05 
 
 		 488 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  21.83 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  23.63 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  22.17 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  23.4 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  22.94 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  22.73 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  22.73 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  26.91 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  21.69 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  29.49 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  22.27 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.18 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  24.68 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.58 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  23.25 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.18 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  21.69 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  23.91 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  26.04 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.29 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  19.86 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 279 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 378 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  21.21 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 284 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.42 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.46 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  31.05 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  21.7 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  24.54 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.75 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  25 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  26.91 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  23.7 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  28.67 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  24.14 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  25.51 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  27.96 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  22.47 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.16 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.92 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.14 
 
 		 632 aa  60.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  22.92 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  21.62 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  21.74 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  23.73 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  27.75 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  19.21 
 
 		 283 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 703 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  21.67 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.1 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  26.48 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  26.48 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  20.8 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  22.11 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.48 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  19.69 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>