More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3869 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
295 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  82.75 
 
 
267 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  72.53 
 
 
277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.62 
 
 
255 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  60.08 
 
 
261 aa  326  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  62.06 
 
 
254 aa  325  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  59.52 
 
 
261 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.52 
 
 
261 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  60.78 
 
 
261 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  60.24 
 
 
261 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  57.09 
 
 
271 aa  315  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  59.92 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.36 
 
 
267 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 
254 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 
282 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  60.71 
 
 
271 aa  309  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.4 
 
 
257 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  56.92 
 
 
278 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  58.23 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  55.37 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56.08 
 
 
256 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 
592 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 
245 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 
274 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  52.12 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.38 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.38 
 
 
263 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  55.95 
 
 
254 aa  272  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  54.33 
 
 
259 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  55.16 
 
 
254 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  53.94 
 
 
259 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  50.58 
 
 
260 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.39 
 
 
254 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  55.02 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  53.54 
 
 
269 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  53.2 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.6 
 
 
240 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  52.59 
 
 
263 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  53.2 
 
 
250 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  53.2 
 
 
255 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  53.44 
 
 
254 aa  262  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  54.84 
 
 
256 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  52.4 
 
 
244 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.34 
 
 
247 aa  262  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  54.22 
 
 
267 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.99 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  52.31 
 
 
267 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.17 
 
 
268 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  53.91 
 
 
262 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  52.8 
 
 
256 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  54 
 
 
252 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  51.36 
 
 
264 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  53.78 
 
 
265 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  51.14 
 
 
289 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.06 
 
 
244 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  52.78 
 
 
252 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.56 
 
 
595 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.4 
 
 
242 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  53.01 
 
 
261 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  52.8 
 
 
245 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  54.22 
 
 
254 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  52.16 
 
 
246 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 
240 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  52.99 
 
 
265 aa  258  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.18 
 
 
260 aa  258  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  51.78 
 
 
248 aa  258  9e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  52.31 
 
 
257 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.8 
 
 
244 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.2 
 
 
245 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  52.8 
 
 
267 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 
261 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  50.99 
 
 
246 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.41 
 
 
263 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 
289 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.6 
 
 
240 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  51.95 
 
 
288 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.28 
 
 
250 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  51.34 
 
 
255 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  52.99 
 
 
264 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  51.38 
 
 
247 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  56.2 
 
 
265 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
262 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  51.79 
 
 
258 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  52.8 
 
 
240 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  52.4 
 
 
255 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 
240 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.99 
 
 
254 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 
240 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  52.42 
 
 
244 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  51.97 
 
 
246 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52 
 
 
242 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 
240 aa  255  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  52.78 
 
 
240 aa  255  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  52.78 
 
 
240 aa  255  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  51.42 
 
 
247 aa  255  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 
240 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
240 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  50 
 
 
265 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.28 
 
 
250 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 
240 aa  254  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>