148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3813 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  100 
 
 		 165 aa  338  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  74.1 
 
 		 166 aa  256  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  72.29 
 
 		 166 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  74.7 
 
 		 166 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  73.49 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  80.29 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  78.1 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  78.1 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  63.25 
 
 		 166 aa  224  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  40.31 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  36.52 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  36 
 
 		 147 aa  84.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  32.8 
 
 		 151 aa  84  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  35.42 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  35 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  38.33 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  32.64 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  34.03 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  34.03 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  38.6 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  36.07 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  35.78 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  34.23 
 
 		 520 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  34.23 
 
 		 520 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  33.33 
 
 		 516 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  34.69 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  33.33 
 
 		 520 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  40.23 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  33.33 
 
 		 520 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  33.33 
 
 		 520 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  33.33 
 
 		 520 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  35.45 
 
 		 479 aa  64.3  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  40.48 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  39.29 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  33.9 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.71 
 
 		 749 aa  60.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  30.97 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  32.38 
 
 		 587 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 762 aa  57.4  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3330  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  39.08 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  31.78 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 		 577 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  30.63 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  30 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  29.21 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.79 
 
 		 759 aa  54.3  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  28.36 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.37 
 
 		 444 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.29 
 
 		 773 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  32 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 421 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  26.85 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  31.2 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  32 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  29.79 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  26.36 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  34.21 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.67 
 
 		 311 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  27.55 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  34.26 
 
 		 218 aa  52  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.51 
 
 		 601 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  36.04 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  29.2 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 548 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  33.72 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.15 
 
 		 699 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  27.12 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  34.12 
 
 		 481 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.63 
 
 		 436 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.89 
 
 		 427 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  31.19 
 
 		 466 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  33.03 
 
 		 438 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 436 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 436 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  32.73 
 
 		 473 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  32.32 
 
 		 644 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  29.91 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.9 
 
 		 1068 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 712 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  26.45 
 
 		 728 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.11 
 
 		 427 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.53 
 
 		 448 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 388 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 388 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 		 389 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 		 389 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  33.64 
 
 		 429 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>