More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6134 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  88.37 
 
 
469 aa  823    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  77.49 
 
 
486 aa  755    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  78.21 
 
 
479 aa  766    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  81.37 
 
 
472 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  87.12 
 
 
477 aa  835    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  81.82 
 
 
479 aa  768    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  93.18 
 
 
469 aa  914    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  82.87 
 
 
467 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  94.03 
 
 
469 aa  919    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  77 
 
 
474 aa  742    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  82.87 
 
 
467 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  82.87 
 
 
467 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  88.29 
 
 
468 aa  845    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  82.66 
 
 
467 aa  797    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 
469 aa  966    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  80.43 
 
 
469 aa  773    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  80.49 
 
 
479 aa  755    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  78.26 
 
 
471 aa  743    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  82.87 
 
 
467 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  81.84 
 
 
474 aa  775    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  81.37 
 
 
476 aa  793    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  88.31 
 
 
469 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  57.83 
 
 
468 aa  542  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  58.17 
 
 
462 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  56.86 
 
 
465 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  58.85 
 
 
470 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  47.39 
 
 
457 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  43.36 
 
 
477 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  38.6 
 
 
432 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  39.08 
 
 
434 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  35.85 
 
 
441 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  34.99 
 
 
505 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.04 
 
 
488 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  32.16 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  34.65 
 
 
524 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  33.53 
 
 
493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  30.16 
 
 
508 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262389 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
530 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  32.72 
 
 
502 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  32.16 
 
 
498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  32.04 
 
 
503 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.4 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.59 
 
 
485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.04 
 
 
493 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.37 
 
 
534 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.54 
 
 
597 aa  97.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  27.1 
 
 
588 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.35 
 
 
519 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.97 
 
 
519 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.14 
 
 
589 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.72 
 
 
470 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  26.05 
 
 
483 aa  87.8  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  26.36 
 
 
517 aa  87.4  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.07 
 
 
482 aa  86.7  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.43 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  24.62 
 
 
608 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  25.05 
 
 
596 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  23.44 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.4 
 
 
517 aa  84  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.55 
 
 
517 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.47 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.73 
 
 
481 aa  83.2  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.7 
 
 
519 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.89 
 
 
589 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.22 
 
 
596 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.22 
 
 
596 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.22 
 
 
596 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.39 
 
 
591 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.62 
 
 
591 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  26.5 
 
 
500 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.87 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.65 
 
 
593 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  27.62 
 
 
589 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  23.83 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.39 
 
 
495 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  30.56 
 
 
1005 aa  77  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  24.45 
 
 
650 aa  76.6  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.51 
 
 
598 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.42 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  26.38 
 
 
507 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  25.1 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  26.33 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.14 
 
 
596 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.59 
 
 
597 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.83 
 
 
584 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20240  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.95 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2868  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.82 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22099  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.54 
 
 
491 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.46 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  25.83 
 
 
493 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  25.83 
 
 
493 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  25.83 
 
 
658 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  25.82 
 
 
631 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1851  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.41 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  26.79 
 
 
570 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  24.43 
 
 
925 aa  70.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.18 
 
 
596 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  26.53 
 
 
570 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.18 
 
 
596 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.18 
 
 
596 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>