More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4264 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  100 
 
 
134 aa  266  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  88.72 
 
 
136 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  88.72 
 
 
136 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  88.72 
 
 
136 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  84.33 
 
 
134 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  84.44 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  83.7 
 
 
135 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  60 
 
 
136 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  58.46 
 
 
136 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  58.46 
 
 
136 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  57.69 
 
 
136 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  56.91 
 
 
138 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.62 
 
 
403 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 
175 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 
175 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  30.99 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  37.04 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  32.8 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  35.2 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  35.14 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  34.23 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  34.23 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  31.5 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  35.43 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  28.24 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  34.23 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  26.19 
 
 
214 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.82 
 
 
237 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
240 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  36.7 
 
 
213 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.75 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 
223 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 
220 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  31.67 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  27.87 
 
 
211 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  36.19 
 
 
213 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 
213 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  32.23 
 
 
227 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  34.51 
 
 
221 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  26.89 
 
 
223 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
212 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.17 
 
 
215 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  27.87 
 
 
211 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.17 
 
 
215 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  31.67 
 
 
214 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
216 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
214 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
219 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1992  response regulator receiver protein  36.79 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108622  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  29.31 
 
 
215 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  32.73 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  32 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30.17 
 
 
215 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.17 
 
 
215 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.17 
 
 
215 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.17 
 
 
215 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.17 
 
 
215 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
215 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.17 
 
 
215 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.3 
 
 
225 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  28.93 
 
 
214 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  31.82 
 
 
234 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
216 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
234 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 
213 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 
220 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  34.29 
 
 
214 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1864  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
205 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  34.55 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  31.73 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  30.1 
 
 
306 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  31.73 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  31.73 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.8 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  31.73 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  31.73 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  31.73 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  31.73 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.66 
 
 
234 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4860  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 
236 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.142587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1151  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
225 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  34.11 
 
 
218 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>