More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3077 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 323 aa  642    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  68.2 
 
 		 308 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  61.69 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  60.71 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  61.17 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  61.17 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  60.98 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  61.69 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  61.04 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  61.89 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  60.84 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  61.76 
 
 		 308 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  60.2 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  59.87 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  59.87 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  59.02 
 
 		 309 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  58.75 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  60.2 
 
 		 312 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  63.04 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  58.75 
 
 		 309 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  59.54 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  58.75 
 
 		 309 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  58.09 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  59.6 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  56.77 
 
 		 311 aa  341  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  55.59 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  54.25 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  53.11 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  53.38 
 
 		 315 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  54.58 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  43.14 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  36.43 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  30.73 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  34.22 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  27.34 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  29.15 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  32.39 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  32.39 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  32.39 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  32.39 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  32.39 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  32.39 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  33.88 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  35.71 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.72 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  31.88 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  30.99 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  30.99 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  30.99 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  34.59 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  32.65 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  33.06 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.22 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.35 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  34.59 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.35 
 
 		 428 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  34.09 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  38.26 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  32.23 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.23 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.5 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  36.15 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.23 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>