More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3048 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3048  rare lipoprotein A  100 
 
 		 116 aa  234  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3250  rare lipoprotein A  55.34 
 
 		 103 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.314972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  49.45 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  49.45 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  47.67 
 
 		 360 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  47.67 
 
 		 360 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  48.42 
 
 		 342 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  50 
 
 		 200 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  42.28 
 
 		 145 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  38.35 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  46.99 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  47.67 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  45.74 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  43.14 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  48.84 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  44.12 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  55.07 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  44.19 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  45.35 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  41 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  44.68 
 
 		 279 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  44.21 
 
 		 314 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  45.35 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  41.88 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  53.73 
 
 		 367 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  48.89 
 
 		 238 aa  77.4  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  48.84 
 
 		 217 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  44.94 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  42.27 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  53.62 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  42.55 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  43.02 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  42.55 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  43.02 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  42.55 
 
 		 266 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  43.02 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  43.02 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  46.43 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  42.55 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  42.05 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  43.02 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  43.02 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  43.02 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 259 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 335 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  41.3 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  59.09 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  44.83 
 
 		 281 aa  73.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  37.07 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  35.04 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  41.86 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  43.68 
 
 		 341 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  45.35 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  41.86 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  47.3 
 
 		 361 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  47.3 
 
 		 361 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  42.39 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  44.05 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  57.58 
 
 		 238 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  42.55 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  35.58 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  39.52 
 
 		 279 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  49.25 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  41.86 
 
 		 270 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  41.11 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  40.66 
 
 		 246 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  41.51 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  44.71 
 
 		 325 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  52.31 
 
 		 169 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  60 
 
 		 175 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  37.61 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>