More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0580 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.24 
 
 		 254 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.4 
 
 		 250 aa  340  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.53 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.4 
 
 		 251 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.29 
 
 		 253 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.07 
 
 		 252 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.34 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.11 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  69.6 
 
 		 256 aa  328  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.26 
 
 		 252 aa  328  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  63.49 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.14 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.49 
 
 		 253 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.49 
 
 		 253 aa  324  7e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.1 
 
 		 253 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.49 
 
 		 253 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.75 
 
 		 255 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.06 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.49 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.35 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.74 
 
 		 269 aa  318  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.7 
 
 		 253 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.74 
 
 		 269 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62 
 
 		 254 aa  314  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.53 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.83 
 
 		 253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 		 254 aa  301  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.63 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.11 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.6 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.42 
 
 		 252 aa  291  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.85 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.28 
 
 		 194 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  54.8 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  54.22 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.82 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 		 254 aa  263  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.52 
 
 		 275 aa  258  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  50.41 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 277 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.28 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 		 254 aa  184  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 252 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.21 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>