More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03780  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 380 aa  731    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  59.73 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  56.91 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  57.34 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  54.18 
 
 		 377 aa  322  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  46.03 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.92 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  45.79 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0347  aminotransferase class V  60.2 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.55 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  44.44 
 
 		 392 aa  292  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.79 
 
 		 394 aa  291  9e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.11 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.11 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.01 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.01 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.22 
 
 		 404 aa  288  9e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.7 
 
 		 396 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.79 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.71 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.6 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  49.13 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.12 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.06 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  44.06 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.13 
 
 		 398 aa  275  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.2 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.99 
 
 		 393 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15700  cysteine desulfurase family protein  52.07 
 
 		 390 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.69 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  48.54 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0244  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.22 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.42 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.63 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.05 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  41.33 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.69 
 
 		 396 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  39.36 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  39.52 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  41.22 
 
 		 389 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.52 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  41.22 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  38.99 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.58 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.02 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  49.16 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  40.8 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  41.32 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.53 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.4 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  42.05 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  42.05 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.73 
 
 		 389 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  45.74 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  40.92 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  46.42 
 
 		 1139 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  43.88 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  40.92 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.37 
 
 		 1143 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  46.56 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.26 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  43.39 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  40.76 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  40 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  42.06 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  43.98 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  38.99 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  39.37 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  42.37 
 
 		 418 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  40.7 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  38.73 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  37.94 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.59 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  38.99 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  38.99 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.03 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.93 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  41.11 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  43.52 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  41.42 
 
 		 403 aa  242  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 381 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  43.54 
 
 		 1135 aa  242  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  43.65 
 
 		 408 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  43.16 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 388 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  39.36 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  37.11 
 
 		 417 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.63 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>