114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0582 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 345 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  70.79 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  67.25 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  66.27 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  65.38 
 
 		 435 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  47.12 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  44.19 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  33.44 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  33.44 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  34.05 
 
 		 512 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  32.44 
 
 		 548 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  32.7 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  32.67 
 
 		 423 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.18 
 
 		 451 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.98 
 
 		 439 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  32.59 
 
 		 465 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  29.27 
 
 		 546 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.92 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  32.91 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  29.43 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 454 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  28.4 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  27.57 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  26.27 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.65 
 
 		 831 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.96 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.84 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.58 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.67 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1493 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.18 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28.65 
 
 		 684 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.88 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1402 aa  57  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.19 
 
 		 685 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.83 
 
 		 528 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1032 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.93 
 
 		 565 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  26.97 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.71 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.43 
 
 		 490 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.22 
 
 		 490 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 448 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  24.88 
 
 		 1003 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  24.18 
 
 		 961 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  25.87 
 
 		 307 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  33.1 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 252 aa  50.8  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3443  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 248 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  29.65 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24.53 
 
 		 2413 aa  50.1  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.78 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.72 
 
 		 509 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.72 
 
 		 509 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  29.36 
 
 		 913 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 1196 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  24.54 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  28.32 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  26.47 
 
 		 693 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.81 
 
 		 789 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.82 
 
 		 890 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  27.66 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.81 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  27.66 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.92 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3379  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.27 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.287446  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.92 
 
 		 232 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1134 aa  47  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  28.97 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1002 aa  46.6  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  25.44 
 
 		 245 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  25.88 
 
 		 271 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 346 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.02 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  27.72 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  42 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.16 
 
 		 552 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.2 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  28.93 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.69 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.33 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  29.09 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  38.24 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  29.33 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  40 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  24.42 
 
 		 233 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  25.43 
 
 		 746 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  42 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  23.84 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.03 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  28.44 
 
 		 1134 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  26.47 
 
 		 523 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>