More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6449 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  86.1 
 
 		 403 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  792    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  87.1 
 
 		 403 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  97.54 
 
 		 406 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  87.73 
 
 		 383 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  97.54 
 
 		 406 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  64.23 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  50 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 408 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  53.28 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  51.97 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.13 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 449 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  23.96 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  24.68 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  21.14 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.8 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  25.08 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  28.68 
 
 		 435 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  24.87 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  20.46 
 
 		 436 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  25 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.8 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>