More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5727 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  91.94 
 
 		 433 aa  768    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  92.63 
 
 		 434 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  84.62 
 
 		 436 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  97.7 
 
 		 434 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  850    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  91.94 
 
 		 433 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  64.53 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  63.83 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  64.52 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  55.47 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 410 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 444 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 428 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  25 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 437 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  29.66 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 453 aa  86.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 430 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.52 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.89 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  23.54 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  25.71 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  25.28 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.3 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.3 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.3 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  26.49 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  26.49 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.3 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>