More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4101 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  828    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 		 444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  35.27 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.98 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.7 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.18 
 
 		 417 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 441 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.1 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 415 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.55 
 
 		 408 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 401 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.41 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  27.51 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.86 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  27.51 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 402 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  32.56 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.14 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.14 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  28.17 
 
 		 378 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.14 
 
 		 408 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  28.17 
 
 		 378 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  28.17 
 
 		 378 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  29.47 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 420 aa  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  20.19 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.45 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  23.52 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 441 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  30.86 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.87 
 
 		 1833 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.31 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.71 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.95 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.21 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.21 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>