More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3878 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3878  transport system permease protein  100 
 
 		 386 aa  716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  71.85 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  62.72 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2760  transport system permease protein  76.45 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.325591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  62.33 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  55.34 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  52.62 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  58.92 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  51.27 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  49.69 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  49.69 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  49.53 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  46.51 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  50.35 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  47.54 
 
 		 340 aa  253  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  45.27 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  45.27 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  45.27 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  42.02 
 
 		 366 aa  242  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  47.18 
 
 		 370 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  48.15 
 
 		 361 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  49.65 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  44 
 
 		 330 aa  236  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  44 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  40.82 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  45.95 
 
 		 334 aa  229  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  48.43 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  41.86 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  47.22 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  41.39 
 
 		 355 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  45.82 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  47.02 
 
 		 356 aa  222  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  43.9 
 
 		 345 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  51.41 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.59 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.94 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.19 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  41.95 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.54 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  42.86 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  46.09 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  39.94 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.77 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  44.41 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  49.65 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.82 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  41.86 
 
 		 330 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40.27 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  34.63 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  40.79 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  48.24 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  42.96 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  42.82 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  44.98 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  41.46 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.02 
 
 		 338 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  49.09 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  42.9 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  41.43 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.35 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  41.92 
 
 		 345 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  44.6 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  38.46 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.36 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.36 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  43.94 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  42.2 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.38 
 
 		 315 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  49.49 
 
 		 345 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  37.72 
 
 		 334 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5428  transport system permease protein  44.59 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5434  transport system permease protein  44.59 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.197656  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.71 
 
 		 367 aa  202  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  38.87 
 
 		 338 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.94 
 
 		 336 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.56 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  42.06 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  39.32 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  46.29 
 
 		 338 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.42 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  46.39 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.91 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.92 
 
 		 332 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.64 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  45.94 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  41.64 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.94 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  36.56 
 
 		 369 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4589  transport system permease protein  48.11 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  43.93 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  45.77 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  46.53 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  34.71 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  47.7 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  43.73 
 
 		 340 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  36.16 
 
 		 355 aa  195  9e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  46.53 
 
 		 338 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  45.52 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>