More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3633 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 241 aa  461  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  57.5 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  56.38 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  52.48 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  51.2 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  49.59 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  54.38 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  50.64 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.89 
 
 		 226 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  47.08 
 
 		 247 aa  187  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  50.21 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  53.47 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  46.46 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.89 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  48.89 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  37.76 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  50.49 
 
 		 522 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4462  hypothetical protein  51.57 
 
 		 160 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  35.35 
 
 		 341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 		 339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.86 
 
 		 377 aa  109  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  35 
 
 		 365 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 		 376 aa  105  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  31.63 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  31.63 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  34.78 
 
 		 337 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 347 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  29.65 
 
 		 380 aa  89.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.73 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  29.73 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  35.26 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 369 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  36.42 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  26.06 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  27.36 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  28.21 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.59 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  28.85 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.53 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  29 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  29.69 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.04 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  35.1 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  35.1 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  29.03 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  29.03 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  33.11 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  29.38 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  26.06 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  33.11 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  29.03 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  35.1 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  33.11 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>