More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1877 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 344 aa  662    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  62.5 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  57.85 
 
 		 348 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  55.37 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  60.59 
 
 		 342 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  58.12 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.43 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  51.84 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  51.59 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.96 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  53.8 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 357 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  50.29 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  49.72 
 
 		 389 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  51.23 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  52.79 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  43.68 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.34 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.07 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  51.57 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.55 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.66 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.66 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.66 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  52.08 
 
 		 375 aa  256  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.07 
 
 		 361 aa  255  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  41.11 
 
 		 339 aa  255  9e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.65 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  46.29 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.42 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.03 
 
 		 344 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  49 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.91 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  41.28 
 
 		 377 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.07 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  43.9 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.34 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  44.19 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  45.87 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.32 
 
 		 356 aa  235  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  42.23 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.1 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.67 
 
 		 378 aa  232  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.57 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.18 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.02 
 
 		 342 aa  228  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.95 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.95 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.41 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.07 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.88 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.9 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.99 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.38 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 364 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  39.04 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  44.48 
 
 		 361 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.15 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.15 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.57 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.02 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2155  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.37 
 
 		 393 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1055  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 		 345 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.77 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.58 
 
 		 360 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.22 
 
 		 393 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.59 
 
 		 362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.1 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.1 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.96 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.1 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.99 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  41.02 
 
 		 344 aa  215  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  40.29 
 
 		 377 aa  216  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.3 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.26 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  37.31 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.24 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.11 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.54 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.24 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  37.46 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.42 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>