More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0394 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0394  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.351464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2424  50S ribosomal protein L1  52.49 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.551126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1955  ribosomal protein L1  49.54 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  46.67 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 230 aa  225  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  48 
 
 		 233 aa  225  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  46.22 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  46.22 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  46.22 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  46.67 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  44.44 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  45.13 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  48.64 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  44.59 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  45.74 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  46.02 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  47.3 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  45.61 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  43.11 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  44.89 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  46.02 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  43.42 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  45.09 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  43.61 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  47.11 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  44.44 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  46.67 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  48 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  44.25 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  47.35 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  45.58 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  45.5 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  46.15 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  44.84 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  45.7 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  46.15 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  45 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  43.81 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  45.33 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  43.36 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  44 
 
 		 232 aa  201  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  43.56 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  44.44 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  44.89 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  42.67 
 
 		 242 aa  201  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  44.25 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  43.69 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  43.3 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  46.7 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  46.7 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  46.7 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  42.6 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  44 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  46.22 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  44.49 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  43.56 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  44.39 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  42.22 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  42.22 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  42.22 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  44.69 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  46.43 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  45.81 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  45.13 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  43.64 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  42.22 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  43.56 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  42.27 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  43.05 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  45.33 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  47.11 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  41.33 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  43.64 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  43.56 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  45.74 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  42.22 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  42.73 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  43.11 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  44.84 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  47.11 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  40.89 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  46.43 
 
 		 232 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  41.78 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  41.33 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  41.33 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>