More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5179 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 195 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  95.38 
 
 		 195 aa  328  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  74.48 
 
 		 195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  73.47 
 
 		 196 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  71.94 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  71.94 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  46.81 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  51.12 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  42.39 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  42.39 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  42.39 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  37.99 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 237 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  41.62 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.43 
 
 		 378 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.22 
 
 		 452 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 411 aa  78.6  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.81 
 
 		 378 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  42.02 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.38 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.28 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.2 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 378 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 412 aa  61.6  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  36.45 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  35.25 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  28.95 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  22.47 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  41.22 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.57 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  31.91 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.25 
 
 		 383 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.88 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  23.53 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  25.14 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.84 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.07 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  23.76 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  34.31 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  34.31 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.74 
 
 		 365 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.74 
 
 		 365 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.74 
 
 		 365 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  25.85 
 
 		 272 aa  53.9  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>