More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1811 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1811  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.47307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  90.43 
 
 		 414 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  63.83 
 
 		 389 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  45.76 
 
 		 223 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  59.77 
 
 		 391 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  48.54 
 
 		 406 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  51.72 
 
 		 404 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  53.41 
 
 		 421 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  51.72 
 
 		 404 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  51.72 
 
 		 404 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  51.72 
 
 		 404 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  50.57 
 
 		 404 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  58.02 
 
 		 406 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  54.02 
 
 		 394 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  54.02 
 
 		 394 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  53.49 
 
 		 419 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4839  hypothetical protein  52.27 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  53.49 
 
 		 428 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  53.49 
 
 		 421 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  53.49 
 
 		 334 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  54.65 
 
 		 404 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  52.27 
 
 		 411 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  46.9 
 
 		 404 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  53.49 
 
 		 420 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  55.29 
 
 		 404 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.33 
 
 		 420 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  51.61 
 
 		 429 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  52.27 
 
 		 419 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  56.1 
 
 		 425 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  53.49 
 
 		 425 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  52.27 
 
 		 421 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  50.57 
 
 		 417 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  53.85 
 
 		 404 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  46.36 
 
 		 403 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  51.16 
 
 		 424 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  53.49 
 
 		 413 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  52.87 
 
 		 410 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  55.56 
 
 		 421 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  52.33 
 
 		 396 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  47.22 
 
 		 398 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.33 
 
 		 421 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  50 
 
 		 402 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  53.49 
 
 		 405 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  53.09 
 
 		 420 aa  97.1  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  50 
 
 		 404 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  51.76 
 
 		 403 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  53.49 
 
 		 419 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  55.95 
 
 		 419 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  53.49 
 
 		 419 aa  95.9  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  50 
 
 		 424 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  55.7 
 
 		 422 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  55.56 
 
 		 425 aa  95.9  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.5 
 
 		 422 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  48.84 
 
 		 404 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  48.84 
 
 		 404 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  52.87 
 
 		 418 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  52.87 
 
 		 418 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  48.86 
 
 		 275 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  51.16 
 
 		 276 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2310  hypothetical protein  42.99 
 
 		 268 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  52.87 
 
 		 412 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  53.57 
 
 		 424 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  42.24 
 
 		 438 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  42.98 
 
 		 420 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  52.33 
 
 		 416 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  49.47 
 
 		 387 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1280  hypothetical protein  46.15 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  44.14 
 
 		 411 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  60.61 
 
 		 422 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  47.67 
 
 		 407 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  53.66 
 
 		 401 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  51.04 
 
 		 395 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  44.86 
 
 		 402 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  48.81 
 
 		 400 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  48.24 
 
 		 420 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  52.38 
 
 		 419 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  48.84 
 
 		 409 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  51.16 
 
 		 401 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  50 
 
 		 417 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  52.94 
 
 		 419 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  50.59 
 
 		 423 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  50.59 
 
 		 420 aa  90.5  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  39.84 
 
 		 421 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  52.38 
 
 		 419 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  52.38 
 
 		 419 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  47.67 
 
 		 427 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  50.57 
 
 		 404 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  50.57 
 
 		 404 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  47.37 
 
 		 391 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  46.43 
 
 		 395 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  48.81 
 
 		 395 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  51.16 
 
 		 367 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  50.57 
 
 		 404 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3641  Phage integrase  51.76 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  50 
 
 		 419 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  51.19 
 
 		 419 aa  88.2  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  47.67 
 
 		 462 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  48.42 
 
 		 397 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  47.62 
 
 		 390 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>