More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3641 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3641  Phage integrase  100 
 
 		 112 aa  227  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158693  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  55.77 
 
 		 418 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  52.94 
 
 		 407 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  52.94 
 
 		 405 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  55.17 
 
 		 394 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  54.46 
 
 		 400 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  47.62 
 
 		 404 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  50.98 
 
 		 404 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  48.54 
 
 		 407 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  47.62 
 
 		 404 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  47.62 
 
 		 404 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.87 
 
 		 402 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  50.49 
 
 		 397 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  50.49 
 
 		 413 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  45.63 
 
 		 404 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  49.5 
 
 		 404 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  48.51 
 
 		 394 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  48.51 
 
 		 394 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  50.49 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  49.04 
 
 		 404 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  47.12 
 
 		 402 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  47.52 
 
 		 417 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  47.62 
 
 		 438 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  49.02 
 
 		 367 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  45.19 
 
 		 420 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  47.32 
 
 		 410 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  46.6 
 
 		 403 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  46.53 
 
 		 404 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  48.04 
 
 		 353 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  48.04 
 
 		 404 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4839  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  47.52 
 
 		 406 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  45.54 
 
 		 410 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  54.76 
 
 		 404 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  51.11 
 
 		 428 aa  90.9  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  54.76 
 
 		 404 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  54.76 
 
 		 404 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  46.53 
 
 		 389 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  52.44 
 
 		 405 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  47.13 
 
 		 395 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  46.53 
 
 		 391 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  52 
 
 		 418 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  43.4 
 
 		 403 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  46.67 
 
 		 412 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1811  hypothetical protein  51.76 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.47307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  44.76 
 
 		 276 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  45.28 
 
 		 411 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  49.41 
 
 		 396 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  55 
 
 		 424 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  51.04 
 
 		 429 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  55 
 
 		 424 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  49.51 
 
 		 421 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  55.56 
 
 		 425 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  47.57 
 
 		 419 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  46.6 
 
 		 419 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  50.56 
 
 		 396 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  47.57 
 
 		 419 aa  87  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  51 
 
 		 418 aa  87.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0310  integrase  47.19 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0285947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  45.37 
 
 		 439 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  47.73 
 
 		 334 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  43.14 
 
 		 395 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  48.54 
 
 		 419 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  46.74 
 
 		 275 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  46.74 
 
 		 401 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  48.54 
 
 		 411 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  48.86 
 
 		 420 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  54.32 
 
 		 425 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  45.1 
 
 		 421 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  43.81 
 
 		 404 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  46 
 
 		 419 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  40 
 
 		 390 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  47 
 
 		 421 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  45.1 
 
 		 414 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  44.76 
 
 		 413 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  50 
 
 		 399 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  47.73 
 
 		 420 aa  84  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1854  putative integrase prophage protein  42.57 
 
 		 199 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  40 
 
 		 401 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.74 
 
 		 422 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  47.73 
 
 		 421 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.88 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.88 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  40.2 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  44.44 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  46 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  46.08 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  45.88 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  44.55 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  46.81 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  46.08 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  51.22 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  45 
 
 		 419 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  42.72 
 
 		 398 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  40.59 
 
 		 421 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  46.32 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  41.75 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  47.06 
 
 		 404 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  51.85 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  43.69 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>