49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1638 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  100 
 
 		 936 aa  1904    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  42.77 
 
 		 924 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  43.32 
 
 		 924 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  25.52 
 
 		 1021 aa  163  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  23.27 
 
 		 1031 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  23.38 
 
 		 1031 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  23.62 
 
 		 1063 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  24.35 
 
 		 914 aa  111  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  27.03 
 
 		 1028 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  27.03 
 
 		 1028 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  27.03 
 
 		 1028 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  28.33 
 
 		 913 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  37.02 
 
 		 732 aa  101  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1366 aa  94  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1354 aa  93.2  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  23.18 
 
 		 1122 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  32.04 
 
 		 738 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  28.05 
 
 		 1707 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  22.59 
 
 		 853 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  22.59 
 
 		 853 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  23.53 
 
 		 853 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  22.29 
 
 		 849 aa  75.1  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  22.73 
 
 		 1161 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  21.78 
 
 		 857 aa  74.7  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  21.29 
 
 		 859 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  21.29 
 
 		 859 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  47.73 
 
 		 811 aa  73.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  49.38 
 
 		 620 aa  72  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  26.39 
 
 		 1167 aa  72  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  28.26 
 
 		 1380 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  38.58 
 
 		 1127 aa  69.3  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  22.87 
 
 		 957 aa  60.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  27.76 
 
 		 1104 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  40.91 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  39.77 
 
 		 612 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  26.69 
 
 		 1222 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  52.94 
 
 		 1173 aa  58.5  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  27.52 
 
 		 1318 aa  58.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  22.53 
 
 		 970 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1006 aa  54.3  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  22.39 
 
 		 1835 aa  52.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  23.17 
 
 		 908 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  35.11 
 
 		 1343 aa  52.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  52.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  41.18 
 
 		 1366 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  24.23 
 
 		 1906 aa  48.9  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  25.35 
 
 		 1251 aa  46.2  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  22.05 
 
 		 1555 aa  46.2  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1056 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>