126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2330 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2330  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  713    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1002  hypothetical protein  84.84 
 
 
349 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0331823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2051  hypothetical protein  85.67 
 
 
347 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2245  hypothetical protein  85.34 
 
 
346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2106  hypothetical protein  84.84 
 
 
349 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.588734  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1817  hypothetical protein  67.32 
 
 
679 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2121  hypothetical protein  67.32 
 
 
345 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0487  putative oxygenase  67.32 
 
 
345 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0389  putative oxygenase  66.67 
 
 
345 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0804  oxygenase  67.77 
 
 
342 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0623  hypothetical protein  47.71 
 
 
358 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0332957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  31.79 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  34.62 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  29.95 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2122  hypothetical protein  76 
 
 
51 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.73 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.94 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  34.19 
 
 
349 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  29.94 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  35.19 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  30.21 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  29.79 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  33.05 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  31.4 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.03 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  30.91 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  30.56 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  28.72 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  36.45 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  34.26 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  28.81 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.11 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.74 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  33.63 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  34.26 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.26 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2123  hypothetical protein  69.05 
 
 
84 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  30.19 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.97 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35.77 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.95 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  33.64 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.14 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  34.65 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  31.33 
 
 
347 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.14 
 
 
351 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  35.4 
 
 
342 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.05 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  29.31 
 
 
423 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.7 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.33 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  29.69 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  32.17 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  36.19 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.36 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.33 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  26.42 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  39.29 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  24.86 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.75 
 
 
354 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  32.63 
 
 
348 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  37.04 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  31.58 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.57 
 
 
358 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  27.54 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  40.28 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  31.07 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  34.82 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.82 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.82 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  42.11 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  35.14 
 
 
366 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  25 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  28.93 
 
 
346 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  34.75 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  37.66 
 
 
359 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  27.27 
 
 
366 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  30.7 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.69 
 
 
364 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  35.19 
 
 
352 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  39.13 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.18 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.76 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  29.41 
 
 
355 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  33.78 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.26 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  29.52 
 
 
370 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 
351 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  30.61 
 
 
340 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  30.77 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  25.29 
 
 
380 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.57 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  35.14 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  35.14 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  35.62 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  36.63 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  36.84 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>