More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0573 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0573  amidase  100 
 
 		 407 aa  809    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  74.94 
 
 		 437 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  58.96 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  49.15 
 
 		 427 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  51.9 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  47.63 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  37.06 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  41.63 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  41.3 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  35.34 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  37.59 
 
 		 456 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  37.23 
 
 		 456 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  35.66 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  37.44 
 
 		 449 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  37.09 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  35.51 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  35.18 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  39.48 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  39.08 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  36.98 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  36.89 
 
 		 449 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  39.03 
 
 		 462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  36.71 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  36.71 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  37.62 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  39.22 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  35.4 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  36.14 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  38.6 
 
 		 458 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  38.02 
 
 		 458 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  36.9 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  37.26 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  38.6 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  38.6 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  36.14 
 
 		 457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  36.68 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  33.88 
 
 		 463 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  37.4 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  39.22 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  39.22 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  35.16 
 
 		 449 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  39.22 
 
 		 616 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  39.22 
 
 		 616 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  39.22 
 
 		 472 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  39.22 
 
 		 472 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  39.22 
 
 		 616 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  36.79 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  38.85 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  36.57 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  36.87 
 
 		 441 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  38.53 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  37.66 
 
 		 450 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  36.84 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  38.85 
 
 		 458 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  37.01 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  33.51 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  37.6 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  36.12 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  38.46 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  37.84 
 
 		 458 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  35.31 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  35.04 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  32.62 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  31.48 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  33.48 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.73 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  33.66 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  32.61 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  32.37 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  32.4 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  33.68 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  32.66 
 
 		 475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  29.75 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  33.26 
 
 		 454 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  31.94 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3243  amidase  29.45 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.25 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  34.24 
 
 		 477 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  31.09 
 
 		 457 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  28.86 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  31.62 
 
 		 446 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  30.68 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  31.88 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  31.66 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  30.69 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  28.77 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  30.91 
 
 		 465 aa  133  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  30.91 
 
 		 465 aa  133  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  30.53 
 
 		 422 aa  133  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  28 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  27.66 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4787  Amidase  33.16 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  27.03 
 
 		 470 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  31.91 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  27.87 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.33 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  35.7 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  29.84 
 
 		 471 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  29.27 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  29.98 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>