More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1695 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1695  pullulanase-like glycosidase  100 
 
 
846 aa  1765    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  43.62 
 
 
771 aa  551  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  42.32 
 
 
748 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  44.27 
 
 
738 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  45.78 
 
 
720 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1345  glycogen debranching enzyme GlgX  44.4 
 
 
756 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412399  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.7 
 
 
710 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  44.26 
 
 
729 aa  485  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  42.12 
 
 
701 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  42.18 
 
 
745 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19030  glycogen debranching enzyme GlgX  45.66 
 
 
747 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  42.55 
 
 
721 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10400  glycogen debranching enzyme GlgX  47.34 
 
 
822 aa  482  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  43.94 
 
 
705 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  43.94 
 
 
705 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  43.94 
 
 
705 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  43.28 
 
 
739 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  41.43 
 
 
700 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  41.59 
 
 
708 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  42.46 
 
 
708 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  43.43 
 
 
739 aa  476  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  45.9 
 
 
704 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  41.74 
 
 
708 aa  475  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  42.48 
 
 
720 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  42.83 
 
 
756 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  44.33 
 
 
712 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.86 
 
 
711 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  43.23 
 
 
704 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  40.54 
 
 
751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 
709 aa  467  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  41.1 
 
 
706 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  43.52 
 
 
727 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40.64 
 
 
712 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  42.27 
 
 
704 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  41.54 
 
 
719 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  46.07 
 
 
802 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0857  glycogen debranching enzyme GlgX  48.47 
 
 
703 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  41.99 
 
 
709 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  40.53 
 
 
712 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 
712 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  43.08 
 
 
704 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  40.87 
 
 
723 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  41.03 
 
 
714 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  43.99 
 
 
719 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  41.61 
 
 
701 aa  466  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  40.96 
 
 
720 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  42.46 
 
 
717 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  40.72 
 
 
713 aa  462  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  42.61 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  39.61 
 
 
766 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  39.02 
 
 
706 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  42.39 
 
 
698 aa  462  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  41.44 
 
 
688 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  43.68 
 
 
727 aa  462  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1337  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  41.96 
 
 
707 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  42.18 
 
 
1464 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  39.61 
 
 
766 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09570  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 
732 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213931  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  41.23 
 
 
717 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  43.34 
 
 
720 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.55 
 
 
755 aa  459  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  41.9 
 
 
716 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  39.88 
 
 
738 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  43.34 
 
 
722 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  41.43 
 
 
730 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  42.46 
 
 
704 aa  458  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  42.39 
 
 
716 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  43.34 
 
 
720 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.13 
 
 
758 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.13 
 
 
758 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  38.17 
 
 
754 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  42.76 
 
 
715 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  43.17 
 
 
701 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  41.08 
 
 
717 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  41.08 
 
 
717 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  41.48 
 
 
757 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  41.08 
 
 
717 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  39.72 
 
 
738 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  41.19 
 
 
703 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  40.98 
 
 
718 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 
712 aa  454  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  40.8 
 
 
711 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  42.64 
 
 
711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  42.32 
 
 
714 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  39.34 
 
 
703 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  40.71 
 
 
719 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  42.48 
 
 
711 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  38.32 
 
 
733 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  40.44 
 
 
716 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  39.94 
 
 
728 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  38.84 
 
 
752 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  40.97 
 
 
710 aa  452  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  40.16 
 
 
706 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  41.48 
 
 
718 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>