96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1056 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  820    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  39.43 
 
 
418 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  40.12 
 
 
414 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  36.32 
 
 
414 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  34.95 
 
 
415 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  38.54 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  37.26 
 
 
414 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  32.58 
 
 
415 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  33.06 
 
 
415 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  37.74 
 
 
415 aa  176  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  34.62 
 
 
425 aa  170  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  33.67 
 
 
421 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  36.18 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  33.66 
 
 
423 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  36.98 
 
 
410 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  35.18 
 
 
390 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  36.66 
 
 
410 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  33.75 
 
 
441 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  32.48 
 
 
434 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  34.43 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  32.3 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  31.22 
 
 
435 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  32.75 
 
 
430 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  31.08 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  30.94 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  34.23 
 
 
435 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  32.59 
 
 
407 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  31.73 
 
 
435 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  33.53 
 
 
409 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  34.47 
 
 
460 aa  117  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  31.21 
 
 
440 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  35.33 
 
 
417 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  32.12 
 
 
387 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  28.62 
 
 
420 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  33.98 
 
 
420 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  30.26 
 
 
420 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  29.18 
 
 
440 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  28.73 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.63 
 
 
411 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.88 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  28.5 
 
 
431 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  28.41 
 
 
330 aa  93.6  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  30.26 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  27.19 
 
 
430 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  27.44 
 
 
405 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.82 
 
 
430 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  28.92 
 
 
408 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  30.27 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  30.11 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  26.69 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  28.15 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  29.19 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  50 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  26.21 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  25.72 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  25.65 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  25.81 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  25.91 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.45 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  23.98 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.32 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  27.2 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  26.77 
 
 
435 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.24 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  27.33 
 
 
429 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.71 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  26.05 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  24.62 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  25.63 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  26.36 
 
 
429 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  24.5 
 
 
449 aa  60.1  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.08 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  23.47 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  26.98 
 
 
433 aa  56.6  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  29.53 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  22.44 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.8 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  27.01 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  29.17 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  23.82 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  28.5 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.19 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  23.3 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  28.02 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.76 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  28.72 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  22.29 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  28 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  25.98 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  28.42 
 
 
447 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  23.79 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  26.97 
 
 
448 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25 
 
 
430 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>