287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0676 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  350  5.9999999999999994e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  44.83 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  45.61 
 
 
127 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  45.69 
 
 
115 aa  103  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  46.96 
 
 
140 aa  97.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  44.17 
 
 
122 aa  97.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  44.27 
 
 
139 aa  97.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.62 
 
 
153 aa  95.9  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  45.3 
 
 
128 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.8 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  44.63 
 
 
123 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  35.29 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.87 
 
 
125 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.87 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.44 
 
 
126 aa  87.4  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  45.37 
 
 
127 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  42.4 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  44.07 
 
 
135 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  44.07 
 
 
135 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.3 
 
 
127 aa  85.1  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37.8 
 
 
127 aa  85.1  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  43.22 
 
 
121 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 
115 aa  84  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  43.22 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  43.24 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.29 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  42.16 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.38 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  43.3 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  42.16 
 
 
122 aa  79  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  36.97 
 
 
122 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.83 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  42.16 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  42.98 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.23 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  36.59 
 
 
129 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 
124 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  36.51 
 
 
126 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  38.94 
 
 
118 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  40.54 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  40.52 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  39.66 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  34.48 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  36.19 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  40.48 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  31.15 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.28 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  38.05 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40.21 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  33.88 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  40.48 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  36 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.26 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  40.34 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.79 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  46.91 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  40.54 
 
 
134 aa  72  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  42.37 
 
 
121 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 
120 aa  72  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  36 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  36.44 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  39.81 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  42.5 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  43.88 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  35.35 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  39 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  32.77 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  34 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  41.84 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  39 
 
 
125 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.64 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  41.84 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  33.86 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  33.88 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  41.84 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.13 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  37.9 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  28.81 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  40.91 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  36.36 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  39.09 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  42.31 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  39.05 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  39.05 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  39.05 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  32.17 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  41 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  39.05 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  35.92 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  39.05 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  32.2 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  39.05 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  40.82 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  39.05 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  39.05 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>