More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4594 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  74.07 
 
 
275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  74.81 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  73.7 
 
 
275 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  73.98 
 
 
275 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.4 
 
 
273 aa  355  6.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  63.08 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.91 
 
 
276 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.35 
 
 
260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.24 
 
 
263 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.02 
 
 
275 aa  292  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.92 
 
 
260 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  58.69 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.18 
 
 
266 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 
261 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.18 
 
 
270 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.42 
 
 
265 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 
261 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  55.22 
 
 
274 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
261 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.43 
 
 
266 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 
264 aa  275  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.52 
 
 
274 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  55.25 
 
 
261 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 
265 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 
264 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  55.94 
 
 
278 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 
262 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  52.31 
 
 
277 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 
261 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.6 
 
 
262 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
266 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  54.41 
 
 
264 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  55.3 
 
 
261 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  55.3 
 
 
261 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  55.3 
 
 
261 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  51.54 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.08 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  51.7 
 
 
265 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  51.53 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  54.37 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.66 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 
272 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 
272 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 
269 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 
269 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.81 
 
 
269 aa  245  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.72 
 
 
260 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
269 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  52.19 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  53.39 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  51.45 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.61 
 
 
273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  53.2 
 
 
269 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  51.91 
 
 
267 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  51.2 
 
 
272 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.8 
 
 
272 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.13 
 
 
270 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.25 
 
 
269 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 
263 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.63 
 
 
261 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 
255 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.16 
 
 
257 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
258 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.54 
 
 
257 aa  184  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
258 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
254 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
258 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
255 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
255 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
255 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
257 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
257 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
264 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
258 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  32.49 
 
 
283 aa  143  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
259 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
261 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
257 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
259 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
260 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
258 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>