67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3221 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3221  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2155  class II aldolase/adducin family protein  47.7 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2032  class II aldolase/adducin family protein  44.71 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635701  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14011  hypothetical protein  33.43 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1997  class II aldolase/adducin family protein  36.28 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2186  hypothetical protein  45.69 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2575  hypothetical protein  47.18 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1395  class II aldolase/adducin-like  37.9 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2749  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0696  class II aldolase/adducin family protein  23.64 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 705 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  31.74 
 
 		 694 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 		 701 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  28.88 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  26.3 
 
 		 653 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  26.47 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 698 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 		 684 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  28.91 
 
 		 705 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 		 696 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 		 691 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  28.32 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  27.62 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  27.43 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  26.03 
 
 		 657 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  26.03 
 
 		 657 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  29 
 
 		 706 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 		 715 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 		 689 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  27.49 
 
 		 705 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 		 701 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1605  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.59 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  29.53 
 
 		 683 aa  53.5  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  25.87 
 
 		 689 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  26.84 
 
 		 701 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 		 677 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  28.64 
 
 		 687 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 679 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  29.51 
 
 		 677 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 		 684 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 		 726 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  29.51 
 
 		 677 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  29.3 
 
 		 680 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  29.51 
 
 		 677 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  31.79 
 
 		 690 aa  49.7  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 676 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.64 
 
 		 677 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 		 678 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  27.93 
 
 		 729 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 685 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  27.62 
 
 		 698 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 680 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  29.5 
 
 		 691 aa  46.2  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 698 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  28.02 
 
 		 700 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 		 705 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4067  class II aldolase/adducin family protein  29.95 
 
 		 254 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  26.52 
 
 		 707 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  27.78 
 
 		 730 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  28.04 
 
 		 682 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  27.53 
 
 		 222 aa  42.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 652 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>