More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1168 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 275 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  54.83 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  54.55 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  53.94 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  50.77 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  53.6 
 
 		 262 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  53.36 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.39 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  50.92 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  49.8 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.19 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  51.11 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  54.95 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  51.38 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  49.41 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.25 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  52.87 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48 
 
 		 259 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.13 
 
 		 274 aa  235  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.98 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  49.4 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  54.67 
 
 		 263 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  52.63 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.47 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  46.67 
 
 		 269 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.66 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.08 
 
 		 259 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  45.8 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  48.22 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.64 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  47.64 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  47.64 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 261 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  49.6 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.96 
 
 		 304 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  52.74 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.93 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.98 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  51.44 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.43 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50.43 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  52.21 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.12 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.57 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  47.01 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.44 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 		 261 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.04 
 
 		 259 aa  224  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  51.07 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.9 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  52.13 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  48.44 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4846  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.31 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.18 
 
 		 254 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  50.68 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  45.52 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  46.4 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.6 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  49.6 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.91 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  47.35 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  51.72 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.33 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  46.4 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.34 
 
 		 288 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.67 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50.48 
 
 		 254 aa  221  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  47.01 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.78 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.45 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  47.27 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  48.9 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.36 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.49 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.74 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.48 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.44 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.28 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.98 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>