More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0734 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 315 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  52.13 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  50.87 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  57.14 
 
 		 316 aa  268  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  47.54 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  47.88 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  45.81 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  51.32 
 
 		 337 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  46.5 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  52.68 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  50.69 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  54.85 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 324 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  53.36 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  47.73 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  41.49 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3641  inner-membrane translocator  50.37 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  45.67 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  48.16 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  44.64 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  38.96 
 
 		 594 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 652 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  43.28 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0860  inner-membrane translocator  46.71 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.18038  normal  0.215748 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 358 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 329 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  40 
 
 		 597 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  40.61 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  43.1 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4045  inner-membrane translocator  50 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  34.89 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  42.22 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  40.22 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  37.21 
 
 		 852 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.2 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  41.91 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  36.46 
 
 		 838 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  35.36 
 
 		 332 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.36 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.77 
 
 		 646 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  35.21 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  34.15 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  37.59 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>