94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  100 
 
 
559 aa  1100    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  52.51 
 
 
558 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  47.21 
 
 
656 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  50.18 
 
 
564 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  48.19 
 
 
547 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  46.31 
 
 
538 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  46.31 
 
 
551 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  45.33 
 
 
556 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  48.92 
 
 
529 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  40.97 
 
 
546 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  43.64 
 
 
532 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  40.04 
 
 
533 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  45.07 
 
 
536 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  42.07 
 
 
531 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  41.19 
 
 
531 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  41.19 
 
 
540 aa  287  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  39.19 
 
 
602 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  27.09 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  23.76 
 
 
523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  24.52 
 
 
428 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  26.13 
 
 
510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  26.21 
 
 
518 aa  114  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  25.31 
 
 
510 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  24.56 
 
 
431 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  24.69 
 
 
509 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.61 
 
 
530 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  33.01 
 
 
508 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  33.01 
 
 
508 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.21 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  28.4 
 
 
259 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.39 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  32.84 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.55 
 
 
214 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  27.17 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  27.14 
 
 
513 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  30.99 
 
 
248 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.03 
 
 
246 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  25.71 
 
 
513 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.71 
 
 
513 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  25.71 
 
 
513 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  25.71 
 
 
513 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  25.71 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  33.15 
 
 
259 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  30.12 
 
 
249 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.18 
 
 
257 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  28.48 
 
 
246 aa  65.1  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  26.67 
 
 
513 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.71 
 
 
513 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  30.05 
 
 
242 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  27.04 
 
 
251 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  28.22 
 
 
253 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  24.76 
 
 
513 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.06 
 
 
244 aa  62.4  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  29.77 
 
 
252 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  33.09 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  35.71 
 
 
242 aa  61.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  29.3 
 
 
375 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  24.64 
 
 
221 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.14 
 
 
251 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  28.48 
 
 
252 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  26.47 
 
 
253 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  24.54 
 
 
520 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  24.32 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.44 
 
 
254 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  29.03 
 
 
356 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  30.52 
 
 
274 aa  57.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  34.86 
 
 
225 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  22.98 
 
 
236 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.93 
 
 
252 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  28.31 
 
 
357 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  28.32 
 
 
250 aa  53.9  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.78 
 
 
257 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  30.15 
 
 
256 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  32.42 
 
 
235 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.37 
 
 
252 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  26.24 
 
 
207 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  32.48 
 
 
502 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30.91 
 
 
202 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  31.82 
 
 
239 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  30.84 
 
 
229 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  31.25 
 
 
610 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  23.5 
 
 
526 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  26.76 
 
 
234 aa  50.4  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  27.21 
 
 
255 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.94 
 
 
237 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.12 
 
 
341 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  26.24 
 
 
203 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  28.89 
 
 
266 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  24.44 
 
 
551 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.3 
 
 
207 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  36.9 
 
 
354 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  28.22 
 
 
492 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  24.78 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>