More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9504 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  100 
 
 
272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 
269 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 
270 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
286 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  39.64 
 
 
273 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
272 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  26.34 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.37 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.6 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.41 
 
 
367 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.7 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  25.88 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  34.04 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  36.84 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  36.84 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  41.76 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.61 
 
 
370 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  23.26 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.54 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  36.84 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.73 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.33 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  24.88 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.51 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  34.21 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  34.21 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  34.21 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  34.21 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  34.21 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  34.21 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  34.21 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
361 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  25.38 
 
 
456 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  37.93 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  40.54 
 
 
335 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
343 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  32.46 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
350 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
354 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00103151  hitchhiker  0.0000592748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
299 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.92 
 
 
380 aa  62.4  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
345 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.36 
 
 
368 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  23.19 
 
 
301 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.99 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  30.82 
 
 
341 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.89 
 
 
372 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  31.01 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.74 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.36 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>