More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2475 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
158 aa  316  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  77.42 
 
 
157 aa  247  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  67.57 
 
 
165 aa  194  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  60.25 
 
 
173 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  62.16 
 
 
157 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  62.16 
 
 
157 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  60.13 
 
 
160 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  55.03 
 
 
163 aa  159  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
170 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 
182 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
154 aa  104  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 
170 aa  104  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  37.74 
 
 
180 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
171 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
171 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 
168 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
171 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
171 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 
168 aa  100  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  39.63 
 
 
170 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 
176 aa  100  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 
154 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  39.63 
 
 
176 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
149 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
173 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  42.86 
 
 
364 aa  99  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 
359 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  42.14 
 
 
359 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  44.53 
 
 
358 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
170 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
170 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  41.56 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 
182 aa  97.4  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 
178 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  38.27 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  44.36 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 
165 aa  94.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38.31 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 
160 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  37.34 
 
 
166 aa  91.3  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
169 aa  91.3  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  37.11 
 
 
160 aa  90.9  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  32.69 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  32.69 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  34.76 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.57 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 
358 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
178 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 
171 aa  87  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 
168 aa  87.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
174 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40.56 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  40.8 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
357 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>