More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3339 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 495 aa  999    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  87.58 
 
 		 470 aa  823    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  62.63 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  60.13 
 
 		 450 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  57.82 
 
 		 500 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  55.31 
 
 		 474 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  55.28 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  51.11 
 
 		 452 aa  425  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  48.74 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  47.18 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  43.97 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  44.07 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  43.05 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  45.21 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  41.65 
 
 		 496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  40.22 
 
 		 442 aa  306  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  43.25 
 
 		 411 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  39.41 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  38.41 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 		 425 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  37 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  37.13 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 699 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  34.34 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  32.33 
 
 		 390 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 359 aa  96.7  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.58 
 
 		 393 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  39.86 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 385 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 399 aa  95.1  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 386 aa  94  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.39 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 362 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  33.12 
 
 		 403 aa  90.1  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 359 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  25.21 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.24 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.52 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  24.18 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 360 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 380 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 337 aa  76.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 330 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.19 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.59 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.19 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  29.55 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.87 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 715 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.43 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.74 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 680 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.58 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.71 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>