More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0271 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  81.62 
 
 		 234 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 265 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  34.38 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.86 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  31.34 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  37.5 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  31.82 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  31.82 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.33 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  30.04 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.96 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.48 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.78 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  32.42 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 287 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  32.59 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  36.97 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  31.17 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  28.57 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  34.88 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  28.82 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.35 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.48 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  31.62 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.45 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  30.91 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.45 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.45 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  34.26 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  27.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  27.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  27.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  27.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  27.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  27.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  27.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  27.8 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.88 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  30.91 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  29.15 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  34.6 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  27.88 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  32.84 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  33.18 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  32.04 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  29.33 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  31.08 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>