More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1616 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  55.66 
 
 
662 aa  742    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  55.66 
 
 
662 aa  742    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  49.01 
 
 
666 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  49.01 
 
 
666 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  56.17 
 
 
662 aa  744    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  55.71 
 
 
664 aa  705    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  55.4 
 
 
664 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  55.34 
 
 
666 aa  747    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  54.49 
 
 
661 aa  711    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  56.95 
 
 
668 aa  759    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  54.87 
 
 
674 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  55.94 
 
 
666 aa  750    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  55.71 
 
 
664 aa  697    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  55.79 
 
 
666 aa  748    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl349  transketolase  53.1 
 
 
655 aa  665    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.9216400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  55.56 
 
 
664 aa  698    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  55.64 
 
 
666 aa  748    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  55.83 
 
 
664 aa  699    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  55.4 
 
 
664 aa  694    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  51.44 
 
 
668 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  100 
 
 
662 aa  1361    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  54.87 
 
 
674 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  55.94 
 
 
666 aa  750    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  48.79 
 
 
668 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  55.49 
 
 
666 aa  742    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  55.19 
 
 
680 aa  746    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  55.2 
 
 
659 aa  702    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  55.64 
 
 
666 aa  748    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  49.17 
 
 
678 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.85 
 
 
668 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  48.79 
 
 
668 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  55.64 
 
 
680 aa  748    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.55 
 
 
668 aa  648    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  50.68 
 
 
667 aa  663    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  55.64 
 
 
666 aa  744    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  57.47 
 
 
668 aa  774    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  55.71 
 
 
664 aa  700    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  49.32 
 
 
666 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  55.34 
 
 
666 aa  740    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  52.42 
 
 
665 aa  681    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  55.35 
 
 
659 aa  706    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  53.73 
 
 
658 aa  699    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  50.15 
 
 
679 aa  675    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  53.74 
 
 
658 aa  668    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  50.46 
 
 
662 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  47.87 
 
 
671 aa  633  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  49.85 
 
 
668 aa  632  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  46.53 
 
 
688 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  48.94 
 
 
666 aa  631  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0610  transketolase  51.06 
 
 
656 aa  629  1e-179  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0812266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  47.38 
 
 
711 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  47.85 
 
 
653 aa  630  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  48.26 
 
 
674 aa  627  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  48.78 
 
 
670 aa  625  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  47.25 
 
 
669 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  49.09 
 
 
669 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  46.88 
 
 
670 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  49.01 
 
 
682 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  47.03 
 
 
670 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  49.16 
 
 
681 aa  625  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  46.63 
 
 
684 aa  619  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  47.95 
 
 
669 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  50.08 
 
 
675 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  48.79 
 
 
672 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  47.8 
 
 
666 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  46.49 
 
 
711 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  48.39 
 
 
667 aa  614  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  46.94 
 
 
668 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  49.85 
 
 
670 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  47.12 
 
 
668 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  48.94 
 
 
670 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  47.95 
 
 
669 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  49.85 
 
 
670 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  48.71 
 
 
664 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  48.18 
 
 
655 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  46.64 
 
 
668 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  47.14 
 
 
672 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  47.88 
 
 
668 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  46.58 
 
 
669 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  46.3 
 
 
665 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  47.18 
 
 
664 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  47.5 
 
 
664 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  47.5 
 
 
664 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  47.5 
 
 
664 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  46.71 
 
 
664 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  46.12 
 
 
655 aa  592  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  46.8 
 
 
657 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  46.55 
 
 
664 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  47.1 
 
 
660 aa  592  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  47.09 
 
 
668 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  46.71 
 
 
664 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  46.34 
 
 
663 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  46.34 
 
 
663 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0788  transketolase  46.96 
 
 
663 aa  588  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000527477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  46.34 
 
 
663 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  46.42 
 
 
664 aa  589  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  46.49 
 
 
663 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  46.05 
 
 
691 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  45.79 
 
 
666 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  46.05 
 
 
691 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>