More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0614 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  100 
 
 		 474 aa  956    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  36.24 
 
 		 547 aa  249  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1929  trigger factor  34.93 
 
 		 501 aa  233  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000213413  normal  0.0186919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11720  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  31.84 
 
 		 554 aa  186  8e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.94 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  29.23 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  29.23 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.24 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  28.4 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  26.25 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  27.03 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  28.8 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  27.62 
 
 		 428 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  26.56 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  24.78 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  28.44 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  26.01 
 
 		 428 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  26.85 
 
 		 435 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27.13 
 
 		 438 aa  126  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  28.5 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  28.47 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  28.47 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  28.47 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  28.24 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  28.24 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  28.24 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  28.24 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  28.24 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  25.78 
 
 		 432 aa  123  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  28.24 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  26.01 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  28.74 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  26.67 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.09 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  26.85 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  26.27 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  27.73 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2176  trigger factor domain protein  27.05 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  27.55 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  27.23 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  27.71 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  26.59 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  27.42 
 
 		 431 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  26.56 
 
 		 473 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  25.64 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  27.05 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  27.13 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  24.3 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  24.55 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  24.55 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  24.65 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  26.79 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  26.08 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  28.08 
 
 		 466 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  25.06 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  26.93 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  25.68 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  25.34 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  27.89 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  27.46 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  26.93 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  27.32 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  25.61 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  25.62 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  25.82 
 
 		 491 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0761  trigger factor  25.88 
 
 		 502 aa  106  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.58 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  23.46 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  28.25 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  25.82 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04590  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  30.63 
 
 		 430 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00333842  hitchhiker  0.0000000448049 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  28.69 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  27.82 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  24.09 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  26.71 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  27.82 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  26.99 
 
 		 403 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  24.69 
 
 		 439 aa  100  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  24.88 
 
 		 448 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  24.11 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  27.25 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  25.69 
 
 		 506 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  27.06 
 
 		 454 aa  97.8  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  25.94 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  27.49 
 
 		 433 aa  97.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  26.06 
 
 		 512 aa  97.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  24.1 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  26.5 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  24.94 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  26.5 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  25.92 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  28.83 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  25.44 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  23.92 
 
 		 481 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  27.68 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  25.17 
 
 		 463 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  28.9 
 
 		 436 aa  94  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  24.51 
 
 		 472 aa  93.2  1e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  25.39 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  23.57 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>