175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1403 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
360 aa  699    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  76.32 
 
 
358 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  72.98 
 
 
360 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  72.14 
 
 
360 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  71.59 
 
 
360 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  26.3 
 
 
362 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  26.99 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 
792 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.45 
 
 
359 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  28.17 
 
 
360 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.32 
 
 
358 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.68 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.3 
 
 
359 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 
360 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  25.28 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  21.78 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  26.29 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  26.08 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  20.67 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  24.03 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  24.37 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  26.8 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  21.9 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  22.35 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  21.8 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  21.88 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  22.01 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  21.73 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  23.18 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.3 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  21.51 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  20.71 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  23.22 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 
361 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 
357 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  21.81 
 
 
365 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  22.04 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  21.95 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  35.96 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  23.53 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 
362 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  18.46 
 
 
357 aa  59.3  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  22.35 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  23.75 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  23.56 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  20.71 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  19.95 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  20.38 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  21.59 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  22.44 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  19.95 
 
 
395 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  23.56 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 
1153 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  20.45 
 
 
1040 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  20.17 
 
 
353 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 
356 aa  57  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  18.29 
 
 
363 aa  56.6  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  20 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>