More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1653 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1653  Ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4448  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  47.44 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 236 aa  201  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.24 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.51 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3605  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.54 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.83 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.71 
 
 		 227 aa  194  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.15 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.66 
 
 		 243 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1664  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00014027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0481  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.62 
 
 		 215 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.91 
 
 		 247 aa  188  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.13 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.32 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 		 228 aa  187  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  42.79 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 		 215 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.02 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.71 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.33 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.4 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.04 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.66 
 
 		 239 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.58 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.26 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.4 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.89 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 225 aa  184  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.52 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 225 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.52 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.83 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.2 
 
 		 220 aa  184  9e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.86 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.12 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.26 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.44 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.76 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.59 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.4 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1908  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.12 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0535  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3573  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.98 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.86 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3554  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0938  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0642  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3581  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.24 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.19 
 
 		 224 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>