More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0245 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  100 
 
 
329 aa  684    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  56.79 
 
 
367 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  55.42 
 
 
367 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  54.46 
 
 
375 aa  371  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 
327 aa  363  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  52.63 
 
 
380 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 
380 aa  363  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  52.48 
 
 
367 aa  363  3e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 
380 aa  362  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 
380 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 
326 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 
326 aa  362  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  52.32 
 
 
326 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  51.86 
 
 
367 aa  361  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  53.56 
 
 
332 aa  359  4e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  54.35 
 
 
371 aa  359  4e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 
365 aa  358  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  51.55 
 
 
366 aa  358  6e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  53.29 
 
 
379 aa  358  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.24 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 
326 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  54.69 
 
 
364 aa  355  6.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  52.04 
 
 
367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  51.4 
 
 
373 aa  352  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  51.83 
 
 
372 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  51.23 
 
 
383 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  51.85 
 
 
365 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 
357 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 
365 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 
365 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 
365 aa  349  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 
365 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  52.5 
 
 
391 aa  349  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  52.19 
 
 
391 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  52.19 
 
 
391 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  52.19 
 
 
391 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  51.88 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  51.88 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
369 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 
364 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 
330 aa  347  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 
357 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  51.88 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
331 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 
341 aa  346  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 
459 aa  345  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 
361 aa  344  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  49.07 
 
 
362 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 
357 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  51.71 
 
 
349 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 
332 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 
406 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  51.39 
 
 
330 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 
371 aa  342  4e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 
364 aa  342  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 
369 aa  342  5e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  52.78 
 
 
372 aa  342  5e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  51.06 
 
 
361 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 
365 aa  341  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  47.85 
 
 
371 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  50.47 
 
 
376 aa  340  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 
359 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  52.63 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  58.01 
 
 
300 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
366 aa  339  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  50 
 
 
365 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 
366 aa  338  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  52.66 
 
 
375 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.1 
 
 
375 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  47.42 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  52.47 
 
 
367 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  52.78 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  49.84 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  51.44 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  50 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  50 
 
 
354 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  52.02 
 
 
360 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  51.23 
 
 
356 aa  335  7.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  49.38 
 
 
365 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 
372 aa  334  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 
365 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  49.06 
 
 
349 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 
337 aa  333  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  48.33 
 
 
377 aa  332  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  49.54 
 
 
371 aa  332  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  50 
 
 
356 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.09 
 
 
371 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 
349 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  48.61 
 
 
365 aa  332  7.000000000000001e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  51.53 
 
 
356 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  48.33 
 
 
374 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
344 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 
331 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 
330 aa  329  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  52.61 
 
 
322 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 
310 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 
334 aa  328  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  52.61 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  50.78 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>