More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6769 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  35.43 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  42.39 
 
 		 242 aa  165  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  35.29 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  35.04 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  33.46 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  32.57 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  33.6 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  33.6 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  33.6 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  33.6 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  32.81 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  32.81 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  33.2 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  33.2 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  35.46 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  33.2 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  25.69 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  27.91 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  35.77 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  30.31 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  41.49 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  32.95 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  31.98 
 
 		 278 aa  92  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.74 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  27.91 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  29.62 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  29.55 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  27.13 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  27.49 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  37.3 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  53.62 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  47.19 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.05 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  50.72 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  47.73 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  29.82 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  25.87 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  32.14 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  33.04 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  32.14 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3016  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 132 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  32.39 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  32.17 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  38.04 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>