More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2998 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 203 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  67.33 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  67.65 
 
 		 208 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  63.18 
 
 		 208 aa  240  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  58.21 
 
 		 226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  51.74 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  51.94 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  52.22 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  45.59 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  45.59 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  45.59 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  46.05 
 
 		 396 aa  158  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  52.26 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  42.47 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 		 217 aa  124  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  42.57 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  44.51 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  44.93 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  44.57 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  42.79 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  38.15 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  48.74 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  50.43 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 253 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  45.56 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  48.76 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  45.86 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  43.48 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 544 aa  81.3  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  37.11 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  43.15 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  38.97 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  46.67 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  45.26 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  36.03 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2902  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  40 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2946  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  49.5 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  35.42 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.54 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  38.52 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.95 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  36.11 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  34.93 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.21 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  34.67 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  36.5 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  33.82 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.5 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  35 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  35.48 
 
 		 392 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.17 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  35.51 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  30.28 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  40.18 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  29.9 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  38.84 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.04 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  35.56 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.59 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  30.13 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  41.44 
 
 		 363 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  35.12 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>