216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1347 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  100 
 
 		 275 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  53.85 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  45.32 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  44.65 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  44.65 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  41.73 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  38.1 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  37.28 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  34.52 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  37.27 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  33.94 
 
 		 434 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  36.59 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  36.09 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  36.94 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  35.19 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  34.18 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  30.56 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  34.46 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  35.27 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.84 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  30.26 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.37 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.58 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  38.33 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  34.2 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  34.46 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  32.28 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  33.09 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  34.07 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.26 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  30.97 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  31.54 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.67 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  35.21 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  35.46 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  36.94 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.24 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.41 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.08 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.18 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  36.4 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  31.84 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  30.38 
 
 		 295 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  32.56 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  32.33 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.71 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  24.54 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  28.47 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.67 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  32.75 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.16 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  31.25 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.32 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  29.26 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  36.19 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  30.71 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  30.29 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.1 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  29.7 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  33.85 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  25.52 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  31.72 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.61 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  31.18 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  32.21 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  32.21 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.43 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  33.45 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  30.22 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  34.68 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  31.65 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  27.9 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  29.03 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  33.93 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  28.36 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.07 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.45 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  27.86 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  31.97 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.69 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  29.78 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  25.45 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  33.71 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  28.81 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  30.85 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  28.67 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  30.9 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  32.94 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  27.76 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  32.26 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  29.39 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  28.52 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  32.39 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  26.42 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  28.62 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  27.21 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  25.68 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  31.4 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>