119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1092 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  100 
 
 
495 aa  953    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  44.36 
 
 
510 aa  342  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  45.09 
 
 
512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  44.79 
 
 
492 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  44.57 
 
 
522 aa  310  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  42.2 
 
 
527 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  42.07 
 
 
492 aa  276  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  40.17 
 
 
505 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  39.72 
 
 
519 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  41.08 
 
 
502 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  41.08 
 
 
502 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  41.08 
 
 
502 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  40.12 
 
 
509 aa  246  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  38.51 
 
 
513 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  39.26 
 
 
496 aa  243  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  40.08 
 
 
490 aa  239  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  38 
 
 
517 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  36.15 
 
 
539 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  36.49 
 
 
526 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  42.86 
 
 
598 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  32.76 
 
 
523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  31.29 
 
 
520 aa  110  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  38.75 
 
 
272 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.09 
 
 
508 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.5 
 
 
511 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  32.09 
 
 
310 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  28.24 
 
 
513 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.54 
 
 
508 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.35 
 
 
511 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  32.76 
 
 
920 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  28.23 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  29.67 
 
 
494 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  36 
 
 
588 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  27.69 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  34.76 
 
 
329 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  32.68 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  33.59 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  32.68 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  32.68 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.27 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  29.24 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  31.14 
 
 
543 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  25.86 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  26.69 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  25.88 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  30.08 
 
 
534 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  27.72 
 
 
596 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  33.2 
 
 
545 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.22 
 
 
721 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  34.09 
 
 
358 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  26.11 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  31.64 
 
 
545 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  25.63 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.86 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  33.18 
 
 
490 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.71 
 
 
512 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  31.56 
 
 
328 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.95 
 
 
322 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.21 
 
 
719 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  28.06 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29 
 
 
505 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  24.16 
 
 
518 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.65 
 
 
487 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.05 
 
 
512 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  26.72 
 
 
304 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  29.3 
 
 
524 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  33.93 
 
 
691 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  33.93 
 
 
649 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  23.66 
 
 
519 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  33.93 
 
 
688 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  33.93 
 
 
640 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  33.93 
 
 
640 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  33.93 
 
 
640 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.85 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  32.74 
 
 
265 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  31.3 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.68 
 
 
523 aa  57  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  26.67 
 
 
494 aa  56.6  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  31.98 
 
 
643 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.46 
 
 
521 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  26.58 
 
 
514 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.04 
 
 
291 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  24.54 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  34.6 
 
 
253 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  27.76 
 
 
329 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8259  CHAD domain containing protein  29.37 
 
 
318 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  27.02 
 
 
293 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  28.33 
 
 
291 aa  53.9  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  31.25 
 
 
308 aa  53.5  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  28.9 
 
 
277 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  29.55 
 
 
313 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  30.34 
 
 
512 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  27.01 
 
 
325 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  23.18 
 
 
555 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  26.39 
 
 
510 aa  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  29.27 
 
 
331 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  30.74 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.64 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>