177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1091 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
515 aa  1017    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  53.31 
 
 
525 aa  528  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.67 
 
 
593 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.16 
 
 
584 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.56 
 
 
528 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  49.69 
 
 
558 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  48.37 
 
 
816 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.41 
 
 
533 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.18 
 
 
500 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.6 
 
 
489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.49 
 
 
820 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  43.55 
 
 
473 aa  326  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.88 
 
 
530 aa  326  8.000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.78 
 
 
553 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.27 
 
 
618 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.24 
 
 
655 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.34 
 
 
479 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  34.98 
 
 
795 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.85 
 
 
542 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.6 
 
 
762 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.33 
 
 
546 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.34 
 
 
534 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.04 
 
 
795 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.22 
 
 
605 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.13 
 
 
781 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  34.52 
 
 
777 aa  269  7e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.66 
 
 
613 aa  267  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.09 
 
 
526 aa  262  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.99 
 
 
609 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  38 
 
 
505 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.67 
 
 
527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.04 
 
 
785 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.6 
 
 
534 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.47 
 
 
760 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.64 
 
 
634 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 
765 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.34 
 
 
665 aa  251  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.47 
 
 
547 aa  250  4e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.56 
 
 
821 aa  250  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.69 
 
 
772 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.7 
 
 
779 aa  249  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.12 
 
 
775 aa  249  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  31.1 
 
 
776 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.48 
 
 
481 aa  248  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.39 
 
 
812 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.85 
 
 
533 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  35.86 
 
 
736 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  30.68 
 
 
639 aa  247  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 
618 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.06 
 
 
834 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  31.55 
 
 
639 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.44 
 
 
905 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.25 
 
 
790 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.21 
 
 
812 aa  243  7e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 
549 aa  238  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.34 
 
 
779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.39 
 
 
422 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  33.55 
 
 
637 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.85 
 
 
688 aa  230  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.32 
 
 
447 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.27 
 
 
613 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.78 
 
 
636 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.22 
 
 
766 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.65 
 
 
529 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.43 
 
 
525 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  31.2 
 
 
602 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.74 
 
 
469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  38.48 
 
 
614 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.2 
 
 
636 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 
774 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.03 
 
 
628 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 
688 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.19 
 
 
627 aa  206  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34.02 
 
 
639 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.78 
 
 
673 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.85 
 
 
683 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.43 
 
 
549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.81 
 
 
504 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.5 
 
 
493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 
543 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 
639 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  34.79 
 
 
1140 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.26 
 
 
852 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 
797 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.96 
 
 
794 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.44 
 
 
673 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.82 
 
 
545 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.37 
 
 
858 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.67 
 
 
866 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.37 
 
 
676 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.49 
 
 
868 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 
811 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.88 
 
 
884 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.83 
 
 
888 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.42 
 
 
888 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.84 
 
 
518 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.37 
 
 
807 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.66 
 
 
863 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.55 
 
 
888 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.94 
 
 
896 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>