More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4082 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 455 aa  881    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  90.41 
 
 		 464 aa  736    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  62.9 
 
 		 482 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 465 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  39.69 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 458 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 441 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 478 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 463 aa  246  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 481 aa  242  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 472 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  40.31 
 
 		 452 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 471 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  36.18 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  31.85 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  36.18 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 490 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 467 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  39.22 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  33.91 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  37.8 
 
 		 471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 445 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  32.25 
 
 		 471 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  33.72 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  29.68 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  37.5 
 
 		 456 aa  212  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.57 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  33.48 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  36.11 
 
 		 448 aa  207  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 458 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  43.53 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  28.57 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 459 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  34.19 
 
 		 439 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 439 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  35.25 
 
 		 411 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 447 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  31.4 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  36.78 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  32.81 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  32.46 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  28.26 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  32.19 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 439 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  35.14 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  29.21 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  35.2 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  30.18 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  33.25 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 484 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  27.68 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  26.86 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>